從氣流流向分為：垂直流超凈工作臺和水平流超凈工作臺。超凈工作臺從操作人員數上分：分為單人工作臺和雙人工作臺；超凈工作臺從結構上分：分為常規型和新型推拉及自循環型（僅限垂直流）

超凈工作臺根據氣流方向分為垂直流超凈工作臺和水平流超凈工作臺，垂直流超凈工作臺由于風機在頂部所以噪音比較大但是風垂直吹多用在醫藥工程這樣保證人的身體健康；水平流工作臺噪音比較小風向往外所以多用在電子行業，對身體健康影響不大。根據操作結構分為單邊操作和雙邊工操作兩種形式，按其用途又可分為普通超凈工作臺和生物（醫藥）超凈工作臺。從使用面數上分類分為單面操作、雙面操作；其中需要說明的是，單面雙面只適合于垂直超凈臺，水平超凈臺不存在單雙面之說。